全样本空间全转录组——你的空间转录组数据够“全”吗?
全样本空间全转录组——你的空间转录组数据够“全”吗?答案是不够,但M20 Spatial技术正在改变这一现状。
空间转录组学相比原来的单细胞转录组学,增加了空间信息,从而增加了更多的整合任务。具体而言,分为以下四类:整合相同样本/不同样本的邻近切片 相同样本邻近切片整合:通过算法将同一样本的不同邻近切片上的数据融合在一起,进行统一的聚类分群。
测序方案:新鲜样本空间转录组、石蜡样本空间转录组、免疫组化技术、多重免疫荧光。主要结果:使用空间转录组学技术揭示了TLS中B细胞的反应,包括克隆多样化、选择、扩增等过程。发现TLS+肿瘤中产生了较多的浆细胞(Ig介导产生)、IgG以及凋亡恶性细胞,这表明抗肿瘤效应的活性。